Kyoko vient d’obtenir son diplôme d'Assassine après 8 années d’études dans le mystérieux orphelinat Izanami. En tant que major de promo, elle se voit confier une cible prestigieuse, Amancio Gates, un néo-milliardaire douteux. La jeune Assassine va découvrir que travailler en équipe avec les autres classes de l’école n’est pas de tout repos…